颞下颌关节紊乱自愈时间，与紊乱严重程度、日常保护措施种类，以及自身体质等因素密切相关，如果在疾病的早期及时进行干预，多数在2周到3个月可以自愈。但若干预不及时，颞下颌关节紊乱严重，导致关节结构发生器质性改变，通常不能自愈。
如果颞下颌关节紊乱出现早期表现，包括患者咀嚼肌群疼痛、下颌运动张口闭口疼痛和轻度张口受限，此时给予热敷、避免较大幅度张口、避免咀嚼硬性食物等一系列的日常保护措施，大多数患者可能在1-2周，部分患者可能需要1个月甚至3个月可以自愈。
如果患者早期并没有进行干预，颞下颌关节紊乱病程逐渐迁延，导致关节弹响越来越频繁、关节破坏越来越严重。此时关节已经发生了不可逆的损伤，表现为关节结构器质性改变，比如关节盘穿孔、关节头破坏、关节结节破坏等，多数难以自愈。需要采取外源性的治疗手段，如正畸治疗、关节内镜手术、关节置换等促进恢复。