包子放冰箱冷藏三天后，是不建议吃的。这是因为冰箱冷藏的常规温度是4-8°C，虽然在此环境下绝大多数细菌的生长速度会变慢，但如果存放时间过长，尤其是超过72小时，仍有可能出现细菌滋生的情况，导致包子受到微生物的污染出现变质。一旦食用后可能会导致细菌性肠炎，并出现腹痛、腹泻、恶心、呕吐等不良反应，不利于人体健康。
其次，一些包子如白菜包、韭菜包等蔬菜包，会因为在冰箱存放的时间过长，菜内原来的硝酸盐在还原菌的作用下转化为亚硝酸盐，而亚硝酸盐在低胃酸的胃内，又可在细菌亚硝胺合成酶的催化下，与胺类物质结合生成强致癌物质亚硝胺。若是长期、大量摄入不新鲜的蔬菜包，可能会导致亚硝酸盐食用过量，引起亚硝酸盐中毒。
除此之外，包子冷藏时间过久，也会导致包子中的营养流失，更会失水变硬，影响其松软性，口感变差。因此，建议尽量不吃隔夜存放的食物，以避免对身体造成伤害。