在临床上，吸痰常见5个并发症是缺氧、呼吸道黏膜损伤、支气管痉挛、牙齿受损、心律失常。此外，继发感染、肺黏膜损伤等也比较常见。但由于个体差异不同，并发症的发生几率也会有所差异。
1、缺氧：吸痰主要经过口腔、鼻腔、人工气道将呼吸道的分泌物吸出来，能够保证呼吸道的畅通。但在做气管切开手术的过程中，如果因操作不当或者没有及时地做吸痰处理，则有可能会导致严重的缺氧，甚至还会导致低氧血症的发生，会出现呼吸衰竭；
2、呼吸道黏膜损伤：因吸痰主要经过口腔或者鼻腔进入呼吸道，在操作的过程中如果幅度过大或操作不当有可能会对局部黏膜造成一定的损伤，严重者甚至引起呼吸道黏膜破裂和出血，同时还可伴有疼痛感；
3、支气管痉挛：在吸痰的过程中有可能会对支气管造成刺激，引起支气管痉挛，通常会表现为刺激性的咳嗽和呼吸不畅；
4、牙齿受损：吸痰的过程中使用的器具有可能会对口腔黏膜和牙龈组织造成损伤，引起牙齿疼痛以及牙龈出血等症状；
5、心律失常：在吸痰的过程中吸痰管有可能会刺激到迷走神经，从而会引起心律失常、心慌心悸、胸闷气短等症状；
6、其他：在吸痰时消毒不彻底可能会导致继发细菌感染，引起炎症加重。此外，如果吸痰器和吸引器之间的压力不平衡，则可能会导致吸痰压力过大，从而对肺黏膜造成一定的损伤。