清洗肛门可以使用的药物种类较多，比如生理盐水、高锰酸钾溶液、复方苦参洗剂、康复新液等，需要具体问题具体分析。不论是哪种药物的使用，均需要在医生的指导下进行，切忌自行使用或者更改浓度剂量。
1、生理盐水：主要是指特定比例的氯化钠溶液，肛门直肠疾病以及肛门直肠手术后，都可以使用生理盐水进行清洗。虽然对疾病没有治疗作用，但一般不会刺激皮肤，可起到清洁作用；
2、高锰酸钾溶液：该药为强氧化剂，具有一定的杀菌、消毒作用，一般是使用特定比例的高锰酸钾溶液进行温水坐浴，广泛应用于痔疮、肛裂、肛瘘等疾病的治疗；
3、复方苦参洗剂：具有一定的清热、燥湿、止痒的功效，对于减轻肛周湿疹引起的肛门口潮湿、瘙痒等症状，可用于清洗肛门；
4、康复新液：康复新液既可以促进肉芽组织增生，促进血管新生，改善创面微循环，又可以加速机体病损组织修复，因此可以在肛瘘、肛裂、肛周感染等疾病发作时使用，清洗肝门。