鲍鱼干存放时间过长不建议食用，因为存放时间过长可能会导致细菌滋生、变质和口感变差。在日常生活中应时刻关注食品安全问题，避免食用过期、变质或来源不明的食品。在购买食品时，要仔细查看生产日期、保质期和贮存条件等信息，以确保食品的安全性和新鲜度。
鲍鱼干在存放3年的过程中，尽管其本身是干燥的，但仍有可能受到细菌的污染。随着时间的推移，即使在相对干燥的环境下，耐干燥的细菌孢子可能会在鲍鱼干上着床并繁殖。
芽孢杆菌属的细菌孢子可能在适宜的温度和湿度波动下萌发成细菌，细菌在鲍鱼干上生长会分解其中的营养成分，同时可能产生毒素。如果食用被细菌污染的鲍鱼干，可能会引发食物中毒，出现恶心、呕吐、腹痛、腹泻等症状。
长时间的存放也增加了霉菌生长的风险，霉菌在潮湿或湿度稍有波动的环境中容易在鲍鱼干上滋生。一旦霉菌生长，会产生霉菌毒素，如黄曲霉毒素等。
鲍鱼干应放在通风、干燥、阴凉的地方保存，避免阳光长时间的照射，防止虫蛀发霉等现象的出现，同时存放时也需要远离气味较重的食物，防止串味。如果按照正确的保存方法，鲍鱼干可以储存1-2年。