白芨根可以起到收敛止血、消肿生肌的作用，可用于治疗咳血、吐血、便血、外伤出血、疮疡肿毒、皮肤皲裂等疾病。西医认为，白芨根可以促进上皮细胞修复，辅助参与受损组织和细胞的修复、代谢过程。
临床上经常应用白芨根治疗咳血、吐血、便血。当用于咳血时，可以用白芨根配伍仙鹤草、白茅根，以增强止血疗效，同时可以根据辩证配伍疏风清热、清肝泻火、清热润燥、养阴生津、补气收摄的中药材。当用于吐血时，可以用白芨根配伍白茅根、侧柏叶、茜草、棕榈炭等，增强止血的疗效，同时可根据辩证配伍清胃泻火、清肝泻胃、益气摄血的中药材。当用于便血时，可以用白芨根配伍三七、地榆炭、侧柏叶、茜草等，同时可根据辩证配伍清肝泻胃、清热利湿、活血化瘀、补脾益气、温阳健脾的中药材。
应用白芨根时，不能与川乌、草乌、附子同用，以免药理作用发生冲突。白芨根性属寒，不宜长期、大剂量服用。白芨根外用时，过敏体质者慎用，以免出现过敏性荨麻疹，甚至出现过敏性休克等严重副反应。