木耳烹饪后或者泡发后建议当天食用，不要过夜，因为隔夜的木耳哪怕是放冰箱，也可能滋生细菌，而且木耳内富含的糖、脂、蛋白质、水分等，也为细菌的繁殖提供了营养基础，久置更易于滋生细菌。
当出现变质、变味的情况下，建议不要再食用，可能会发生急性胃肠炎，比如呕吐、腹痛、腹泻等症状，食用过多，还有可能导致食物中毒，会对身体产生不利影响。而且木耳表面长期潮湿易被椰毒假单胞菌污染，就算是在冰箱内保存也并不能防止被椰毒假单胞菌污染，该菌如果被人体大量摄入后可产生米酵菌酸毒素，可以对肝、肾细胞造成损伤，若食用过多甚至可以引起全身多脏器衰竭，严重可致人死亡。
虽然新鲜木耳营养好，口感也比较美味，但是并不适合在冰箱存放太多天，如果放置时间过久，营养和口感都会明显下降，还容易滋生细菌和变质，建议多食用新鲜的食品，提倡营养全面均衡、科学搭配，才更有利于身体健康。