降低精子畸形率可从治疗原发病、避免接触引起精子畸形的理化因素、养成良好的生活习惯、药物调理等方面进行处理，以提高精子质量。
1、治疗原发病：主要是由于精索静脉曲张、前列腺炎、精囊炎、附睾炎等疾病可能导致精子死亡或异变，从而出现精子畸形的情况，因此，建议积极查明病因，遵医嘱给予头孢克肟、磷霉素氨丁三醇、左氧氟沙星等抗生素和特拉唑嗪、多沙唑嗪等α受体阻滞剂等，以降低精子畸形率；
2、避免接触引起精子畸形的理化因素：一般情况下精子从发生到成熟需要3个月左右的时间，而放射线、高温、免疫抑制剂等理化因素容易诱发精子畸形，故应保证3个月内不接触，以降低精子畸形率；
3、养成良好的生活习惯：保证7-8个小时的睡眠，经常锻炼身体，减少吸烟、饮酒量，最好戒烟、戒酒，内裤保持宽松通风，避免使阴囊温度过高。此外，过度抑郁或人际关系严重障碍也可能影响精子畸形率。因此患者要保持心情开朗，多与人沟通交流；
4、药物调理：如果精液分析中发现精子畸形率高，或者精子数量减少，活力减弱，也可以适当用药物，如左卡尼汀，以改善精子成活率和数 量的作用，也可以降低精子畸形率。