黑米粥隔夜在妥善冷藏、储存容器密封、时间不过长且制作过程卫生的情况下可食用，因低温可抑制微生物，若常温放置、容器未密封、时间久、制作有问题则不适合食用，微生物滋生会致营养流失与变质。
从黑米粥本身的成分来看，含有丰富的碳水化合物、蛋白质、膳食纤维、维生素以及矿物质等营养成分。如果黑米粥在隔夜储存过程中，被妥善地放置在冰箱冷藏环境下温度较低，这种低温环境可以有效抑制微生物的生长繁殖速度。黑米粥中的营养成分能够得到较好的保存，而且微生物滋生较少，第二天一般还是可以食用的。
如果黑米粥没有进行冷藏，而是在常温环境下放置了一夜，不建议食用。因为常温环境有利于细菌、霉菌等微生物的滋生和繁殖，这些微生物会分解黑米粥中的营养成分，使粥的口感变差，同时可能会产生对人体有害的代谢产物，食用后可能会导致胃肠道不适，如呕吐、腹泻等症状。
即使黑米粥在冷藏条件下储存，也需要注意储存时间不能过长，如果放置时间超过24小时甚至更久，微生物还是会逐渐滋生，并且粥的营养成分也会逐渐流失。
因此制作黑米粥要保证食材新鲜卫生，隔夜的黑米粥需密封冷藏，若发现粥有异味、变色、发霉等异常不要食用，冷藏时间尽量不超过24小时，食用前检查粥的状态。