玉米煮熟后根部有黑色通常不建议食用，玉米煮熟后根部有黑色可能表明玉米已经变质，食用后可能危害机体健康。
虽然煮熟过程中玉米的某些部分可能会因化学反应而变色，但根部发黑通常不是正常的烹饪现象，而更可能是玉米本身已经变质。玉米在储存过程中，如果时间过长，可能会因为环境湿度、温度等因素导致真菌的侵袭，进而造成玉米根部变质发黑，或玉米根部发黑可能是霉菌生长的直接表现。霉菌不仅影响玉米的外观和口感，更重要的是可能产生对人体有害的毒素，如黄曲霉毒素，长期摄入这种毒素可能对肝脏等器官造成损害。
食用变质的玉米可能导致肠胃不适，如腹痛、腹泻等症状，因为变质过程中产生的有害物质会刺激胃肠道，引发炎症反应。在严重情况下，食用变质的玉米可能导致食物中毒。食物中毒的症状可能包括恶心、呕吐、发热等，甚至可能危及生命。长期摄入含有霉菌毒素的食物可能对肝脏、肾脏等器官造成慢性损害，增加患癌风险。
在购买玉米时，应选择表皮紧实、色泽鲜艳、无霉斑的玉米。避免购买已经变质或存放时间过长的玉米。将玉米存放在干燥、通风、阴凉的地方，避免受潮、受热和阳光直射。储存时间不宜过长，以免变质。在烹饪前，应仔细检查玉米是否变质。如果发现玉米根部有黑色或其他异常现象，应立即丢弃。