豆腐乳放的时间长了，若没有超过保质期、没有出现发霉等变质的情况，通常可以正常食用。若超过保质期，或者因存放不当而出现发霉、变质的情况，则不能食用。
豆腐乳属于发酵腌制食品，通常保质期比较长，豆腐乳存放较长时间后，可能依然在保质期内，此时可观察豆腐乳的形状，若未出现异味、发霉等变质的情况，可以正常食用。但是，如果豆腐乳存放的时间过长，已经超出了保质期，则不能食用，豆腐乳中可能滋生了较多细菌等有害物质。食用过期或者变质的豆腐乳后，可能会出现腹痛、腹泻、恶心、呕吐等不适症状。
未食用的豆腐乳，应在玻璃瓶中密封保存，放置在阴凉、通风、干燥处。另外，应按需购买豆腐乳，以免豆腐乳长期存放出现过期。此外即使豆腐乳可以正常食用，也不建议食用过多，以免摄入过多盐分，增加高血压的发生风险。