鼻窦炎口服液和通窍鼻炎颗粒的组成成分与适应证略有不同，因此两类药物在临床中无法比较哪个好，而需由专业的医生针对不同证型的疾病，选择合适药物进行对症治疗，以免延误病情。
1、鼻窦炎口服液：由辛夷、荆芥、薄荷、桔梗、竹叶、柴胡、苍耳子、白芷、川芎、黄芩、栀子、茯苓、川木通、黄芪、龙胆草等药物组成，具有疏散风热、清热利湿、宣通鼻窍等功效。其中的辛夷、苍耳子属于通鼻窍的常用药，荆芥、薄荷、柴胡则具有疏风、宣热、散表的作用，而黄芩、栀子可清泻肺热，龙胆草能清泄肝胆湿热。因此对风热犯肺、湿热内蕴等疾病导致的鼻塞不通、流黄稠黏涕、急慢性鼻炎、副鼻窦炎等均有一定治疗效果；
2、通窍鼻炎颗粒：属于颗粒剂型，其中包括辛夷、苍耳子、防风、白芷、薄荷、黄芪和白术等药物，可观察到通窍鼻咽颗粒中部分成分与鼻窦炎口服液相似，均含辛夷、苍耳子、薄荷、黄芪等，因此也具有散风消炎、宣通鼻窍的作用，主要用于治疗鼻炎、鼻窦炎和过敏性鼻炎引起的鼻塞、流涕、前额痛等症状，但通窍鼻炎颗粒成分中含有黄芪、白术和白芷，其补虚效果相对更强。
因此，临床需根据患者不同症型的疾病选择合适的药物进行治疗，无优劣之分，若出现严重鼻塞、流鼻涕症状，且身体较虚弱时，可服用通窍鼻炎颗粒。但机体鼻炎症状较轻时，使用鼻窦炎口服液即可，但需在专业医生的指导下使用，不可擅自用药或增减药量，以免导致不良后果。