桂枝甘草汤的禁忌较多，如禁忌人群、禁忌药物以及禁忌久服，暂时未发现有食物的绝对禁忌。若是存在不适症状，建议经专业中医辨证后遵医嘱用药治疗，切勿自行用药，以免导致不良后果。
1、禁忌人群：桂枝甘草汤中主要为桂枝、甘草，且桂枝为主药、用量较大，而桂枝性温可以助热，容易伤阴、动血，故外感热病、血热、阴虚火旺等热证人群忌用桂枝甘草汤。中医理论认为气具有固摄汗液、控制毛孔开合的作用，所以气虚人群会表现为汗出不止，在中医学中津液属阴，而桂枝甘草汤中桂枝伤阴动血，所以对于气虚已极、津液流失严重的人群，使用桂枝甘草汤可能会加重病情；
2、禁忌药物：桂枝甘草汤中含有甘草，而大戟、甘遂、芫花、海藻与甘草不和，会削弱甘草的功效，进而削弱桂枝甘草汤的药效，因此桂枝甘草汤忌与大戟、甘遂、芫花、海藻等药物同用；
3、禁忌久服：桂枝甘草汤温通心阳，温热之性较重，长期服用会造成病人心火旺盛，出现易怒、口舌生疮等表现，所以桂枝甘草汤也禁忌久服。