小便时尿道刺痛首先要到泌尿外科就诊，做尿常规分析。如尿常规中发现有大量白细胞，可诊断为泌尿系统感染，可以吃消炎药进行治疗。消炎药在临床上多称为抗菌药或抗生素，如喹诺酮类、头孢类、大环内酯类等。
1、喹诺酮类：如左氧氟沙星、盐酸环丙沙星，此类药物在尿液中的浓度较高，可有效缓解泌尿系统感染的情况。但是怀孕期、哺乳期的女性，或小于18岁的未成年人应避免使用喹诺酮类药物，以免影响孩子的骨骼发育；
2、头孢类抗生素：如头孢克洛、头孢克肟，在使用时要注意，患者应没有头孢类抗生素的过敏史；
3、大环内酯类抗生素：如红霉素、罗红霉素、克拉霉素、盐酸多西环素、盐酸米诺环素、阿奇霉素等，主要用于治疗需氧革兰氏阳性球菌和阴性球菌、某些厌氧菌以及军团菌、支原体、衣原体等感染，但使用大环内酯类抗生素可能会出现消化道症状，如腹痛、腹胀、恶心、呕吐及腹泻等，需注意观察不良反应；
4、其他药物：小便时尿道刺痛者，可选择耐药率较低的新型抗生素，如磷霉素钙等，其抗菌谱较广且出现耐药的概率较低。
出现小便时尿道刺痛时，药 物的选择需结合尿细菌培养和药物敏感试验的结果综合进行判断，可带来更好的临床效果。在吃抗生素的同时需避免饮酒和吃过于辛辣的食物，饮食应以清淡为主，可多喝水、多休息，有利于症状的缓解。