南瓜羹在不添加糖的情况下热量并不高，每100g南瓜羹含有26Kcal的热量，适合限制热量摄入者食用，具体热量与其浓稠度相关。但市面上的速食南瓜羹热量通常较高，具体应以配料表热量为主。
南瓜为药食两用食物，中医认为南瓜性味甘、温，归脾、胃经，有补中益气、清热解毒的功效，作为饮食适用于脾胃虚弱、营养不足的人群。此外也可辅助治疗肺痈、水火烫伤等。
西医认为，南瓜含瓜氨酸、精氨酸、麦门冬素、多种维生素、果胶、纤维素等。不仅营养丰富，且其中的纤维素可促进肠道蠕动，促进吸收避免便秘等作用，因此对于手术后以及胃肠道疾病或放疗、化疗后需要采取易消化饮食的人群，南瓜羹可作为主食选择。但南瓜中含有较多的糖分，因此糖尿病或血糖较高者可将南瓜羹作为佐餐，但不建议作为主食或长期饮食，以免引起血糖波动，不利于疾病恢复。