三色糙米通常是由红米、黑米、糙米混合形成，升糖指数简称为升指或GI，反映了碳水化合物对人体血糖水平的影响。由于三色糙米属于谷类粗粮，其升糖指数并不是很高，并且其含有的营养物质也相对丰富。
不同的谷类的升糖指数不同，三色糙米中红米的升糖指数大致为49，黑米的升糖指数为50，糙米的升糖指数为55。由于升糖指数小于55为低升糖指数食物，升糖指数55-70为中升糖指数食物，升糖指数大于70则为高升糖指数食物。由此可见，三色糙米中的谷类大多是低升糖指数食物，其升糖指数并不高。而且低血糖指数食物在胃肠中停留时间长、吸收率低，葡萄糖释放缓慢，进入血液后的峰值较低，下降速度也较慢，能够降低血糖和胰岛素的升高幅度，促进脂肪氧化，减少脂肪生成，并增加饱腹感。因此，三色糙米适合糖尿病、肥胖者作为日常主食进行适量食用，但是无法起到降血糖的作用，不可通过食用三色糙米等食物来达到降血糖目的。
虽然三色糙米的升糖指数较低，但是其膳食纤维含量较高，且不易消化，不建议食用过多，除了可导致血糖升高之外，可能还会对胃肠道造成损伤。因此，对于有基础胃病者，建议避免吃或少吃三色糙米，以免出现腹痛等不适症状。