硅是人体必需的微量元素之一，在人体内能够促进生物矿化过程，促进骨胶原的生成，并参与多糖代谢，适当摄入一般不会有明显危害，甚至硅缺乏时对骨质钙化、骨折愈合有影响。但如果摄入过量的硅，可能会引起尿结石或局灶性肾小球肾炎，以及吸入过多含二氧化硅的粉尘，可能导致硅肺。
少量的硅可从尿液代谢出体外，但如果部分人长期喜食茭白、竹笋等高硅食物，或长期服用三硅酸镁等含硅酸盐成分的药物，易使过量的硅酸盐堆积在泌尿系统，久而久之可能会引发尿结石，或局灶性肾小球肾炎。
此外，硅肺又称为矽肺，是尘肺中较为常见的一种类型，是由于在生产劳动中，长期吸入大量含有游离二氧化硅的粉尘于肺泡内沉积，而引起的纤维性病变。随着病情发展，肺部组织逐渐纤维化，严重时可出现呼吸困难，并伴有咳嗽、胸痛等症状。