日常所说的痘痘一般指痤疮，也有人将皮肤的异常凸起称作痘痘。临床引起这种情况的原因有很多，甲硝唑凝胶只对部分情况有用，应该根据病因，在医生指导下选择用药，不建议自行盲目用药，以免影响医生对疾病的诊断，影响疾病治疗。
1、痤疮引起的痘痘：痤疮与痤疮丙酸杆菌感染有关，而甲硝唑凝胶属硝基咪唑类抗生素，具有较强的抗革兰阴性、革兰阳性厌氧菌的作用，因此对于痤疮丙酸杆菌这种厌氧菌具有较强的杀菌活性，可以适当应用。对于痤疮，还可以采取刷酸治疗，起到调整角质功能、剥落老化角质的作用，还能解决表皮和部分真皮病变问题，例如局部还可以用异维A酸凝胶、水杨酸等；
2、其他常见情况：接触性皮炎、荨麻疹、湿疹等原因所致的皮肤凸起，主要是由过敏因素引起，需要服用盐酸西替利嗪片、氯雷他定片等药物进行抗过敏治疗。建议在医生指导下使用甲硝唑凝胶外涂，切勿盲目自行用药，对于此药过敏的患者，不能够使用此药。
由于甲硝唑凝胶还对滴虫、毛囊虫、阿米巴原虫、疥螨等有较强的杀灭作用，因此还可用于治疗滴虫性阴道炎、毛囊虫皮炎、疥疮等疾病。