牙龈与舌根连着的地方肿痛，可能与舌叶状乳头炎、智齿冠周炎、舌根部溃疡、舌根部肿瘤等有关，可根据不同病因，采取不同治疗方法，如一般治疗、药物治疗、手术治疗等。
1、舌叶状乳头炎：舌背黏膜上有许多乳头状突起，其中位于舌根两侧边缘有叶状乳头，为数条平行皱襞。当舌乳头受到细菌或病毒感染时，可表现为叶状乳头充血、发红、突起而出现肿痛，建议遵医嘱给予头孢克肟胶囊、利巴韦林颗粒等抗生素药物治疗；
2、智齿冠周炎：当智齿萌出受阻或位置不足时，会发生智齿冠周炎。冠周牙龈有红肿、充血、溢脓等表现，可导致牙龈与舌根相连处出现疼痛、肿胀。此时遵医嘱给予阿莫西林胶囊、甲硝唑片等抗生素药物，待急性炎症缓解后可拔除阻生智齿；
3、舌根部溃疡：当口腔内磨牙后区存在有残根、残冠，以及磨牙牙尖过锐时，可发生舌根部创伤性溃疡，引起红肿、疼痛，此时可遵医嘱给予西瓜霜、碘甘油局部涂抹，还需要调整过锐的牙尖，拔除残根与残冠等，以促进溃疡愈合；
4、舌根部肿瘤：当舌根部出现肿瘤时，会发生舌根部与牙龈连着的地方肿痛，以及舌体活动受限等。此时可行手术切除舌根部肿瘤，术后行病理检查，以明确诊断。
除上述原因外，可能还有其他原因导致，如严重的咽喉炎等，应及时就诊，完善检查，明确病因及诊断，在专业医师指导下规范治疗。