通常情况下，脑血管血栓应该根据病情的严重程度以及发病时间的长短等因素，在医生的指导下选择采取溶栓、抗凝等药物治疗，还可以选择手术方法进行治疗。
一、药物治疗：
1、溶栓：脑血管血栓的病人可能会出现一侧肢体活动受限、嘴歪眼斜、语言功能障碍、吞咽困难等临床症状。在发病以后的3-6个小时，应该在医生指导下应用阿替普酶或者尿激酶等药物进行溶栓治疗，有利于降低脑代谢，减轻脑水肿；
2、抗凝：如果是心源性栓塞，房颤病人栓子脱落以后导致的脑血管血栓，在发病以后的6个小时之内，可以采取抗凝的方法治疗。临床常用低分子肝素等药物，有利于防止血栓继续发展以及闭塞远端的小血管继发血栓形成；
3、其他治疗：脑血管血栓病人可以在医生指导下，应用依达拉奉等有清除自由基作用的药物，降纤酶等降低纤维蛋白原的药物，血栓通等有扩张脑血管、活血化瘀作用的药物，以及胞磷胆碱等有营养脑细胞作用的药物治疗。如果颅内压增高，可以用甘露醇降低颅内压。
二、手术治疗：
脑血栓栓塞的面积比较大，病人有比较严重的临床症状以及意识障碍的情况下， 如果在发病以后的24小时之内，身体状况允许，可以考虑配合医生采取手术介入取栓的方法治疗。