不建议食用里面已经变黑的白萝卜。白萝卜外表是一层新鲜白皮，若发现里面变黑，可能是萝卜在生长过程中根部缺氧、缺硼，土壤环境过涝，甚至黑腐病菌侵害肉质根，毒素感染后腐败变黑。此外，在高温、高湿环境下，容易导致白萝卜黑心病，部分白萝卜切开后可呈蓝色、绿色，也不建议食用。发蓝、发黑、糠心、变软的白萝卜，不仅影响口感，而且对健康百害而无一利。
如果不慎误食里面变黑的白萝卜，可能会威胁人体健康，轻者可出现腹痛、恶心、呕吐、腹泻等食物中毒症状，而对于造成黄曲霉毒素中毒的严重患者，易出现肝损害。
日常生活中，不能一味因为节约粮食，而不舍得丢弃已经变质、变黑的白萝卜。建议在购买时，认真挑选白萝卜，仔细观察根茎颜色，触摸白萝卜头端位置，观察是否有颜色异常、腐烂现象。还需比较同等大小的白萝卜，如果重量明显偏轻，可能是萝卜里面存在糠心现象。此外，储存白萝卜时建议洗净后沥干水分，再用保鲜袋装好，密封袋封口后放入冰箱冷藏，但也要尽快食用，不可留置过长时间。