喝藿香正气水时尽量不要饮酒，藿香正气水中含有40%-50%的酒精，因此与酒精没有禁忌。但藿香正气水中所含酒精量较少，如服用过量酒精可能会影响藿香正气水药效的发挥，甚至加重病情，故不建议饮用。
藿香正气水含有苍术、陈皮、白芷、茯苓、生半夏、广藿香油等成份，有助于风寒或风热感冒、胸腹部症状表现的胃肠型感冒的治疗。饮用酒类可能会导致体内产生湿气并造成感冒的加重，因此应尽量避免在服用藿香正气水后饮酒。另外，服用藿香正气水时应注意，对所含成分过敏的或对酒精过敏的患者应禁止服用，还应注意在使用藿香正气水时避免服用头孢类药物，如头孢呋辛、头孢他啶等，以免出现联合用药反应。
患者服用藿香正气水后，应注意避免驾驶交通工具或进行精密作业。因藿香正气水中含有的生半夏具有一定的毒性，应严格按照医生建议或根据自身情况，选择用法用量服用。如患者出现不适症状如恶心、呕吐、心悸、头晕、血压下降、呼吸困难等症状时，及时前往医院进行就诊。