长期久坐后，臀部和大腿后侧疼，可能是劳累所致，也可能是腰肌劳损、坐骨结节滑囊炎、梨状肌综合征、骨质增生、腰椎间盘突出症等因素引起，还可能会伴有腰部疼痛等症状。
1、劳累：坐着时臀部肌肉和大腿肌肉为主要压迫点，如果长期久坐，保持同一个姿势，可能会导致此处肌肉疲劳，同时肌肉内可产生较多乳酸，并刺激周围神经，产生疼痛、酸胀等感觉，一般经过卧床休息后可缓解。
2、腰肌劳损：由于长期久坐，或者有的坐姿不良，或总是固定一个姿势而使得腰部软组织长久处于张力状态，软组织缺血，产生腰肌劳损，腰背部疼痛范围可能会较广泛，可向臀部放射。患者可遵医嘱应用双氯芬酸二乙胺乳胶剂等外用于腰背部疼痛处，可有效减轻炎症反应，也可通过热水袋、热敷、电热和红外线等方式解除痉挛。
3、肌筋膜炎：长时间久坐不运动或因长期保持同一个固定姿势、长期负重或因压力过大、劳累过度等，导致臀部以及大腿肌肉处出现无菌性炎症，会诱发肌筋膜炎，常导致患处出现疼痛、僵硬、活动障碍等。患者可遵医嘱应用塞来昔布胶囊、双氯芬酸钠缓释片等药物治疗，也可通过红外线治疗、微波治疗、体外超声治疗等方式进行治疗，在日常生活中要保持身心愉快，纠正不正确姿势，避免长期使用一种姿势造成肌肉劳损。
4、坐骨结节滑囊炎：当人采取坐位姿势时，坐骨结节恰好与凳面接触。在坐骨结节的顶端长有滑囊，滑囊能分泌液体，以减少组织间的摩擦与受压。由于长时间的盘腿久坐或者跷二郎腿，容易使坐骨结节与坐凳接触，久而久之可形成囊肿。患者初起时常感到臀部酸痛不适，坐位时更明显，逐渐会出现硬结样的东西。因此要改变不良的坐姿习惯，不要长时间盘腿而坐或长时间翘二郎腿，使两侧的坐骨结节承受的体重压力达到平衡。
5、梨状肌综合征：由于梨状肌腱受损，长期久坐后加重对坐骨神经造成的压力，造成髋部和髋部的单侧疼痛，严重时还会引起坐骨神经痛，导致大腿处以及小腿出现疼痛，可以在医师指导下进行按摩，如果疼痛剧烈可以口服布洛芬缓释胶囊等镇痛药。
6、骨质增生：是正常骨骼边缘形成的骨性增生物，若长期久坐，椎管内的增生物可以造成椎管狭窄，压迫马尾或硬膜囊而产生下肢坐骨神经痛、间歇性跛行等，患者也会出现臀部以及大腿、小腿部位疼痛的情况。疼痛时可遵医嘱服解热镇痛的非甾体抗炎药，如双氯芬酸钠缓释片、布洛芬片等，对脊髓、神经等组织构成压迫或影响关节活动的骨质增生可进行手术切除治疗。
7、腰椎间盘突出症：随着年龄增加，腰椎会发生退化，出现腰椎间盘突出，而久坐会加重髓核突出，当退变的椎间盘向椎管内突出，压迫、刺激附近的坐骨神经，可引起下腰部放射至臀后部、大腿后外侧、小腿外侧至跟部或足背部的放射性疼痛。患者需及时遵医嘱应用美洛昔康片、塞来昔布胶囊等药物缓解疼痛，也可应用盐酸乙哌立松片来缓解肌肉痉挛，在日常生活中可以睡硬板床，床上铺的垫子不能很厚。
除以上因素外，腰椎结核、椎管内肿瘤等也可引起上述情况，患者可前往医院骨科进行X线、CT、MRI等检查，同时避免久坐，坐着时保持正确姿势。