大脚趾短于第二个脚趾通常不属于疾病，与先天发育有关。如果脚部因外伤导致大脚趾发育不良，也可以出现大脚趾短于第二个脚趾的情况。
1、先天发育：人体的脚型通常受先天发育因素所影响，大脚趾短于第二个脚趾通常是指希腊脚；而大脚趾长于第二个脚趾，五个脚趾长度依次递减的脚型，被称为埃及脚；大脚趾、第二脚趾、第三脚趾基本是处于平行状态，而第四、第五脚趾较短，便称为罗马脚。这些脚趾形态均属于正常情况，与遗传有关；
2、外伤：如果患者两脚的脚趾长度不对称，或两个脚形不对称，且大脚趾短于第二个脚趾，便可能是疾病所导致。可能是患者小时候脚部受到损伤，导致大脚趾的骨骺损伤而出现发育障碍，损伤侧的大脚趾发育迟缓或发育异常而短于第二个脚趾，如果患者没有明显症状，通常可以不进行处理。如果患者因大脚趾较短而影响走路，在走路时磨脚或疼痛，通常需要前往医院进行治疗。对于症状较轻的脚部畸形，可以通过佩戴矫形器进行纠正，对于症状较严重的脚部畸形，需要进行手术处理，通过结构矫形的方式，将病变或存在畸形的脚趾进行矫形，使其恢复正常形态，避免影响 日常生活。
在日常生活中穿舒适的鞋子，对于第二个脚趾比较长的人群，应该选择相对较宽松的鞋子，以避免脚趾受挤压，从而出现磨脚、脚痛等情况。如果出现脚部稳定性变差，或出现关节红肿、疼痛等情况，需要及时前往医院就诊，并进行矫正。