大脚趾根部关节痛的原因有很多，常见原因可以分为两种，一种是生理性原因，另一种是病理性原因，如痛风、骨关节炎、类风湿性关节炎等。
一、生理性原因：
日常生活中运动量较大，走路过多，或是鞋子过小不合脚，均会影响大脚趾根部的血液循环，并且大脚趾根部的关节长时间受到挤压和摩擦，会引起局部肿胀、疼痛，出现大脚趾根部关节痛的情况。建议减少运动量，适当休息，选择宽松舒适的鞋子，通常可以逐渐自行缓解。
二、病理性原因：
1、痛风：是指嘌呤代谢障碍，血清尿酸升高，尿酸盐结晶沉积在关节引起的疾病，好发于大拇趾。如果长时间食用高嘌呤食物，比如烧烤、啤酒等，体内嘌呤含量增高、嘌呤代谢异常，引起尿酸盐结晶，沉积在大脚趾根部关节处，刺激关节会有剧烈疼痛，出现大脚趾根部关节痛的情况，可以遵医嘱使用秋水仙碱片等药物缓解疼痛；
2、骨关节炎：属于逐渐进展的慢性疾病，病因和发病机制尚不明确，可能与感染、创伤、遗传等因素有关，病变通常在关节软骨，主要是由于关节软骨增生，出现关节间隙狭窄，影响关节周围肌肉组织吸收养分，进而使关节软骨退变、纤维化、断裂、缺损，出现疼痛症状，如果发生在大脚趾根部，会有大脚趾根部关节痛的情况，可以遵医嘱使用仙灵骨葆片、双氯芬酸钠缓释片等药物缓解症状；
3、类风湿性关节炎：与自身免疫、遗传等因素有关，是一种全身性疾病，常发生于手指关节，但有一部分人可以发生在大脚趾根部关节处，病理基础是滑膜炎症，逐渐扩大到肌腱、关节软骨、骨组织，导致关节破坏，影响关节正常功能，出现疼痛、活动受限等症状，继而有大脚趾根部关节痛的情况。