小而密低密度脂蛋白偏高是导致心肌梗死、缺血性脑卒中等疾病的危险因素之一，而且小而密低密度脂蛋白偏高，也是动脉粥样硬化症的独立危险因素，对于上肢血管、下肢血管都有一定的影响。
1、上肢血管：小而密低密度脂蛋白偏高容易在上肢血管，如冠状动脉、大脑动脉内沉积，诱发一系列反应，导致上肢血管硬化。如果上肢血管硬化持续发展会引起血管壁增厚，从而引起管腔狭窄，导致血流速度减慢，通过血流所提供到脏器和组织的营养物质、氧气等成分会减少，使组织缺血、缺氧。当沉积于上肢血管的血脂形成斑块破裂时，诱发局部血栓形成，可引发急性大血管闭塞，从而导致心肌梗死、缺血性脑卒中；
2、下肢血管：除影响冠状动脉、大脑动脉等上肢血管外，下肢血管，如肾动脉也会受到累及，从而引起肾动脉狭窄，出现相应的肾脏损害，表现为尿蛋白升高等，还可能导致下肢动脉硬化性闭塞症，早期可无明显症状，仅有轻微不适，如畏寒、发凉等，之后逐渐出现间歇性跛行。