益生菌是指无毒性、无致病性，且达到一定数量时，能对宿主健康提供有益作用的活体微生物，通常可分为双歧杆菌、乳酸杆菌等。在选择益生菌时，应尽量选择已经通过临床认证、具有药用价值的益生菌，而且应选择活性性能较高、活菌数量较多的益生菌，比较健康可靠，可以起到一定调理肠道菌群、保持肠道菌群内环境平衡的效果。
此外，由于所处年龄段不同，所选择的益生菌也有所不同。如果处于婴幼儿阶段，由于胃肠功能尚未发育成熟，如果出现胃肠功能紊乱或者便秘的现象，通常可以选择双歧杆菌进行调理，如可以遵医嘱服用双歧杆菌三联活菌散调理。但是对于免疫力低下以及肠道功能紊乱的成年人而言，通常可以选择乳酸杆菌进行调理，如乳酸菌素片，也可以起到一定调节肠道菌群的效果。
但需要注意，应避免盲目使用益生菌，严格遵医嘱进行使用。如果便秘的情况比较严重，单纯使用益生菌的效果可能不明显，还需要遵医嘱给予乳果糖口服液、开塞露等药物通便，并且明确便秘的原因。