吲哚美辛的不良反应主要体现在消化系统、神经系统，还会引起肝肾损伤等不良反应。而且也会引起过敏反应，主要表现为哮喘、血管性水肿，严重者可能出现过敏性休克。另外吲哚美辛和阿司匹林存在交叉过敏性，由阿司匹林过敏引起的哮喘患者，应用吲哚美辛时可引起气管痉挛。
1、消化系统：吲哚美辛会对胃肠道造成刺激，并引起消化不良、胃痛，以及胃部烧灼感、恶心、反酸水等症状，严重者可能会出现胃溃疡、胃穿孔，甚至是胃出血；
2、神经系统：主要表现为头晕、头痛或者焦虑，还会引起失眠，严重时会出现精神行为障碍以及抽搐；
3、肝肾损伤：吲哚美辛需要经由肝脏代谢，再经由肾脏排泄，所以会加重肝脏、肾脏负担。部分患者会出现血尿以及身体水肿，还会导致肾功能不全，一般老人出现肾损伤的概率会高一些；
4、其他：部分患者应用后皮肤上出现各种类型的皮疹，严重者会出现大疱性多形红斑。还有部分患者可能出现再生障碍性贫血、白细胞减少或血小板减少。