脑彩超与脑CT具有比较大区别，脑彩超检查在临床上主要用于检查血管状况，CT可以检查颅内血管情况、颅内占位、颅内寄生虫、炎症等变化，两者在成像原理、检查目的、辐射程度这三个方面均存在差异。
1、成像原理：脑彩超是利用声波成像原理进行检查，而脑CT是通过X射线断层扫描成像；
2、检查目的：一般脑彩超的超声波穿透力比较弱，无法穿透颅骨，主要通过颅缝检查颅内血管情况，如大脑前、中、后动脉，观察脑血管是否有狭窄、畸形、斑块，以及斑块大小、体积、软硬程度等情况，可以帮助诊断癫痫、脑梗死、脑出血等疾病，以及新生儿颅脑疾病。CT的X线可以穿透颅骨，因此可以清晰地显示出颅骨结构，观察到颅内脑实质结构，如肿瘤、占位、炎症、血管病等问题，可以帮助诊断脑外伤、脑瘤、脑梗死、脑出血、脑萎缩、脑积水等多种疾病；
3、辐射程度：脑彩超没有辐射，而脑CT的X线具有辐射，但通常辐射剂量比较小，一般不会对人体造成伤害。
脑彩超与脑CT通常用于不同的情况，需要医生根据患者的病情进行选择，适合的检查可以较好地为医生提供诊断依据、证据、线索，为医生的诊断，以及制定治 疗方案提供资料，便于医生做出更好的治疗选择。