如果只是空腹喝少量柠檬水，一般并不会产生特别大的影响，但在饮用量比较多的情况下，可能会对胃部产生刺激，严重时会导致胃部疼痛。
柠檬水中的营养成分含量较高，含有多种微量元素及维生素成分，可以为身体提供一部分营养，空腹时候少量喝一般有利于胃肠道吸收和利用营养物质。因此空腹的时候一般可以适量或者是少量地喝一些柠檬水，在饮用量比较小的情况下，一般不会对胃黏膜产生较大的刺激。柠檬水属于一种酸性水，如果在空腹的时候饮用量过多，会对胃黏膜产生较大的刺激，可能会导致胃酸分泌过多，容易引起胃部疼痛和恶心呕吐，可能会造成胃壁痉挛和收缩，并伴有反酸和烧心等症状，也可能会导致胃部疾病加重，如本身患有胃溃疡、十二指肠溃疡、慢性胃炎等病症人群，在喝了之后身体的不适可能会加重。
在日常生活中，如果出现了消化不良症状，可以适当地喝一些柠檬水，有一定的促进消化的效果，但是只能起到辅助的作用，不能作为药物来治疗疾病，平时也应注意饮食多样化。