不小心吃了臭屁虫，可以通过暂时观察、催吐，或遵医嘱进行药物治疗等方式进行处理。日常应注意饮食卫生，避免出现误食虫子、食物中毒的情况。
1、暂时观察：如果做饭时臭屁虫掉入锅内，被煮熟或煮透，此时臭屁虫体内的病原微生物已基本被杀灭，而且臭屁虫进入人体消化道后，被胃酸或胃蛋白酶消化分解，一般不会对人体造成太大影响。如果没有出现不适症状，可以暂时观察，同时注意多饮水，促进排出，不用过于担心；
2、催吐：如果不慎吃了生的臭屁虫，出现恶心、反胃等症状，可以通过刺激舌根、咽部等部位进行催吐，使臭屁虫随着食物从口腔排出，有利于避免有害物质持续刺激胃黏膜，引起不适症状；
3、药物治疗：对于不小心吃了臭屁虫且时间较久，出现恶心、腹痛、腹泻等症状的人群，需要就医检查。如果存在胃肠炎等情况，则应在医生指导下选择盐酸左氧氟沙星胶囊、阿莫西林胶囊等药物，进行抗感染治疗。
此外，如果臭屁虫携带大量病原菌，导致患者出现严重症状，还应遵医嘱进行洗胃、手术等治疗。积极就医处理，减轻不适症状。