通常情况下，颈椎CT和颈椎间盘CT不一样，其检查范围不同。颈椎间盘CT主要以颈椎间盘为主，颈椎CT能清楚显示脊椎的形态、结构、椎间盘病变、韧带钙化及黄韧带肥厚，也能清楚显示颈神经根及脊髓的形态、结构。
颈椎间盘CT可以发现颈椎间盘退变、颈椎间盘突出、神经根和硬脊膜囊的受压程度，属于颈椎间盘突出患者的常见检查。颈椎间盘CT还会检查骨窗，在骨窗内可以发现骨骼变化，比如颈椎骨折、颈椎小关节错位、颈椎管狭窄等，表现为颈椎退行性病变。
在日常检查辅助过程中，颈椎间盘CT是较重要的检查，如果患者存在3个节段左右的颈间盘病变，可使用颈椎间盘CT检查。如果患者存在多节段颈间盘突出、颈椎管狭窄等，通常不会选择颈椎间盘CT检查，而是选择更为广泛的颈椎核磁共振检查，可以显示颈椎整体的并列特征。
颈椎CT是医生诊断颈椎病的重要检查手段，颈椎CT检查可以观察颈椎曲度是否自然，属于正常前曲改变还是变直或反曲，可以观察颈椎椎体后缘序列是否连续，椎小关节、钩椎关节对位情况，确定是否存在颈椎稳定性方面的问题。
另外，通过颈椎CT，可以清晰显示椎体和椎小关节骨质增生情况，观察有无骨赘形成，有无骨性椎管狭窄、椎间孔狭窄。观察患者是否存在椎间盘突出、膨出，突出方向、严重程度，对硬膜囊压迫情况以及突出椎间盘是否造成椎管狭窄，压迫硬膜囊还是压迫神经根。
此外，颈椎CT可以明确是否存在颈椎感染，如颈椎结核。通过颈椎骨质破坏或椎管与椎间孔扩大等征象发现少见疾病，如颈椎肿瘤等。
因此，两者是不同的检查方法，无论进行何种检查方式，建议患者前往正规医院的脊柱外科，由医生通过问诊、视诊、触诊等明确大概的情况后，在医生建议下进行选择。