健康证肛门棉签试管不一定会检查出疣。疣是指机体感染HPV病毒后导致皮肤生出的赘生物，办理健康证时，常通过棉签取粪便样本进行细菌培养，明确是否存在痢疾杆菌、伤寒杆菌等致病菌。是否能够检查出疣，与是否存在疣体相关：
1、有疣体时：若为医护人员进行粪检取样，且肛周有明显疣体，通过视诊可能检查出疣，但需进一步通过血检、醋酸白试验等实验室检查确诊；
2、无疣体时：通常肛门无疣体的人群肛门棉签试管不会检查出疣。若怀疑因感染HPV病毒导致机体出现疣，应及时前往医院检查以明确诊断。
若明确患有疣，应尽早遵医嘱进行治疗。临床常用维A酸乳膏、氟尿嘧啶软膏、水杨酸、干扰素等外用药物，维生素D3、平阳霉素等注射药物，以及左旋咪唑等口服免疫抑制剂进行治疗。还可辅助进行物理治疗，如冷冻治疗、电灼治疗、微波治疗、激光治疗等。
此外，疣通过直接或间接接触可能造成传播，应避免针对疣体进行抓挠、摩擦等行为，同时应针对个人卫生进行管理，以免造成病毒的传播或继发感染等。