在临床上，引起小鱼际肌疼痛的常见原因有颈椎病、尺神经炎、急性外伤、局部受压、慢性劳损、局部感染等。治疗上主要是止痛治疗，但也需要根据导致上述症状的不同原因进行针对性治疗。
1、颈椎病：颈椎病卡压脊髓神经根，导致神经根缺血水肿发炎，引起小鱼际肌疼痛。治疗上主要是颈椎牵引治疗，配合止痛药物和营养神经药物治疗，常用的药物有双氯芬酸钠缓释片、甲钴胺胶囊等；
2、尺神经炎：多见于肘管综合征和腕尺管综合征，在其内走行的尺神经受压，引起神经缺血水肿发炎，导致小鱼际肌疼痛。轻症者可局部热敷、烤电理疗，配合营养神经药物治疗，重症者需要手术治疗，如腕管切开松解减压手术等；
3、急性外伤：小鱼际肌遭受急性外伤，会引起肌肉出血水肿发炎，导致小鱼际肌疼痛。治疗上主要是局部制动，抬高患肢，伤后24小时之内冷敷，伤后24小时之后热敷，口服抗炎止痛药物治疗，常用的药物有布洛芬、双氯芬酸钠缓释片等；
4、局部受压：往往由于姿势不当或者睡觉时小鱼际肌受压，引起局部缺血、乳酸堆积，引起小鱼际肌疼痛，解除受压后一般即可缓解；
5、慢性劳损：由于手部长期从事重体力劳动，导致小鱼际肌肉疲劳出现水肿发炎，导致小鱼际肌疼痛。需减少活动，适当休息，局部热敷烤电理疗，配合止痛药物治疗，常用的药物有双氯芬酸钠缓释片、洛索洛芬钠胶囊等；
6、局部感染：小鱼际肌皮肤破损，细菌入侵繁殖导致局部感染化脓，引起小鱼际肌疼痛。治疗上主要是局部消毒换药，抗感染药物治疗，常用的药物有头孢克肟、阿莫西林等。