南瓜切开后在冰箱中保存2周，可食性会受到一定影响，若冷藏条件较好，且外观、气味无变化，通常可以食用，但是如果储存不当已经出现变质，则不可以进食。
南瓜切开后，若迅速用保鲜膜或容器密封，并置于冰箱冷藏室，通常为4°C左右保存，可有效延缓细菌繁殖和营养流失，在此条件下，南瓜的保质期可相对延长，能够食用，若冷藏温度波动大或密封不严，会加速南瓜变质过程，不宜食用。
检查南瓜切面是否出现霉变、腐烂或颜色变化是判断是否可食的重要依据，同时，闻南瓜气味，若有酸臭、霉味等异常气味，则表明南瓜已变质，不宜食用，相比之下，单纯的颜色变化可能不如霉变和异味严重，但同样应谨慎对待。
长时间冷藏的南瓜，口感可能变得软烂，质地不再紧实，虽然这种变化不一定意味着南瓜已变质，但会严重影响食用体验，因此，即使南瓜外观和气味正常，若口感和质地发生显著变化，也应考虑是否继续食用。
南瓜富含多种维生素和矿物质，但切开后长时间保存会导致部分营养成分流失，尤其是维生素C等易氧化物质，在冷藏过程中也会逐渐减少，虽然营养流失不直接威胁健康，但长期食用营养价值 低的食物不利于营养均衡。