口腔长疱的常见原因包括局部刺激、病毒感染，以及黏液腺囊肿等。由于大多数人无法明确判断，通常需要及时就医进行检查，避免自行用药，应由医生根据检查结果和临床症状等进行综合判断，再给予相应的处理。
1、局部刺激：可能因为进食过烫、过咸、过硬的食物等导致，而进行正畸的部分人群在食物、钢丝，以及口腔黏膜反复摩擦、刺激的情况下，也可能导致黏膜下组织液的聚积，从而出现水疱。一般可以自行吸收，无需使用药物，但需要注意饮食，避免进食过烫、过咸、过硬，以及辛辣、刺激性的食物。如果是正畸人群，需考虑及时调整钢丝，或者使用可食用的正畸保护蜡等手段，减少钢丝对于口腔内壁的摩擦；
2、病毒感染：常见单纯性疱疹导致的急性疱疹性龈口炎，起初口腔黏膜呈片状充血水肿、出血的情况，而后出现小水疱，簇状分布，且较快形成破溃，常伴有颌下淋巴结肿大，可出现发热和疼痛的感觉。此类情况下，通常需要抗病毒治疗，包括应用阿昔洛韦片、泛昔洛韦片等，抑制病毒的复制。为减轻进食疼痛还可局部涂抹普鲁卡因、冰硼散、康复新液等药物，或口服维生素B1、维生素C，以促进康复。此外，饮食上还需要少食多餐，以清淡半流食为主，注意保持口腔的清洁，减少口腔内的细菌、病毒繁殖；
3、黏液腺囊肿：常因为黏液腺排泄管被阻塞，导致腺体内的分泌物潴留在腺泡内，仅有一层黏膜覆盖，呈半透明状，易咬破。而且此类囊肿咬破后可流出黏稠的液体，而后囊肿消失。此类囊肿好发于下唇，且愈合后容易复发，需要注意改变不良咬合习惯，如果情况反复，导致出现瘢痕组织，通常可采用手术切除治疗，如舌下腺切除术。