臭豆腐健康不健康不能一概而论，需要结合食用量以及食用方式进行综合分析。臭豆腐属于发酵豆制品，制作过程中不仅会产生一定的腐败物质，还容易受到细菌污染。从健康角度考虑，多吃对健康并无益处，因此生活中建议控制食用的量。
臭豆腐主要由豆腐加工制作而成，其中蛋白质含量丰富，同时含有丰富的钙质。经过发酵后，蛋白质分解为各种氨基酸，又产生了酵母等物质，所以有增进食欲、促进消化的功效。但豆制品在发酵过程中会产生甲胺、腐胺、色胺等胺类物质以及硫化氢，具有一股特殊的臭味和很强的挥发性，多吃对健康并无益处。
此外，胺类物质存放时间长了，还可能与亚硝酸盐作用，生成强致癌物亚硝胺。而且制作过程中对温度和湿度的要求非常高，一旦控制不好，很容易引发人体胃肠道疾病，而重者还会导致肉毒杆菌大量繁殖，产生一种有毒物质，即肉毒毒素，对健康不利。