刺蒺藜为蒺藜科植物蒺藜的干燥成熟果实，有小毒，若不遵照医嘱，长期大量服用，可能会导致刺蒺藜中毒，表现出乏力、嗜睡、头昏、恶心呕吐、心悸等症状。严重者甚至会出现肺水肿、呼吸衰竭，并可引起高铁血红蛋白血症，甚至导致窒息。因此刺蒺藜长期服用存在一定的副作用，建议用药时谨遵医嘱，以免引起身体不适。
中医认为，刺蒺藜味苦、辛，微温，归肝、肺经。具有祛风，明目，止痒的作用，可用于治疗头痛眩晕、目赤翳障、风疹瘙痒等。此外，刺蒺藜提取液有利于抑制金黄色葡萄球菌、大肠杆菌的生长，黄酮部分具有抑制假丝菌丝类、微白霉素、大肠杆菌和金黄色葡萄球菌的作用。但不论用于治疗何种疾病，都应先咨询专业医生，切勿自行盲目用药，以免对健康造成不良影响。