醋泡黄豆并不存在什么危害，但要注意摄入量，并且对醋和黄豆过敏的人群不建议食用，很可能会出现皮肤红斑、瘙痒等不适，情况严重还可能会出现呼吸困难，从而影响身体健康。
醋和黄豆都是生活中常见的食物，醋含有水分、碳水化合物、钠、磷、镁、铁、钾、钙等营养成分，黄豆含有碳水化合物、不溶性膳食纤维、叶酸、钠、磷、镁、铁、钾、钙等营养成分，都能为身体提供所需的营养物质，对身体健康有好处。临床通常不存在食物相克的说法，可以在用醋泡黄豆后食用，也不存在什么危害。但是不建议摄入过多，以免增加胃肠道的负担或者因为食物的味道过酸而刺激黏膜，导致胃肠道蠕动减慢，从而出现腹痛、腹泻、腹胀等不适症状。
日常生活中要注意合理存放食物，可以将醋泡的黄豆放入冰箱中冷藏保存，以此延长存放时间。当颜色和气味出现改变时，通常提示变质，此时不建议继续食用，很可能会刺激胃肠道，出现腹泻的情况。