胃癌微卫星稳定有一定的临床意义，微卫星是指DNA基因组中小于10个核苷酸的简单重复序列， 是随机分布在几乎所有基因组中的2-6个碱基重复，由于其具有群体多态性，属于重要的肿瘤标志物。微卫星稳定是指正常情况下，DNA复制过程中经常发生错误，而人体内正常错配修复系统可以将复制的错误校对正确。
胃癌微卫星是否稳定主要用于预后判断和治疗，微卫星稳定是一个良好的症状，因为中晚期癌症患者会出现局部扩散，形成卫星状病变，如果采用化疗、放疗、靶向药物治疗、生物治疗、干细胞移植、PD-1治疗等综合治疗方法，可以控制肿瘤的生长、发展和扩散，微卫星病变不会继续扩大和扩散，表明该病已得到一定程度的控制。
同时微卫星稳定与胃癌的治疗与病理分期、病理类型等因素密切相关，如果是早期或高分化微卫星稳定型胃癌，可以通过手术切除治疗，预后良好，不需要化疗。如果微卫星稳定的胃癌在中期伴有局部淋巴结转移，可以考虑化疗。如果是微卫星稳定的晚期胃癌，则化疗效果较好，并能延长患者的生存期。