在大多数情况下，西红柿都是促进健康、增强体质的理想选择，几乎没有特定的疾病明确禁止食用西红柿。即便是普遍被认为对健康有益的食物，在食用时也需要注意一些方面，以确保其发挥最佳的营养效益。
西红柿富含维生素C、维生素A、钾、膳食纤维以及多种抗氧化物质，如番茄红素，对于增强免疫力、保护视力、维持心脏健康、促进消化以及预防某些癌症等方面都具有积极作用。特别是番茄红素，其是一种强大的抗氧化剂，能够有效抵抗自由基的损害，减缓衰老过程，并可能降低患心血管疾病的风险。
西红柿营养丰富，但任何食物的摄入都应遵循适量原则。过量食用可能导致维生素C等营养成分的过量摄入，虽然维生素C过量通常会被身体自然排出，但长期大量摄入也可能引起腹泻等不适。
西红柿的烹饪方式对其营养价值的保留有很大影响，生吃西红柿可以最大限度地保留其维生素C含量，而烹饪则有助于释放番茄红素，使其更易被人体吸收。因此根据个人的营养需求和口味偏好，选择合适的烹饪方式至关重要。
由于西红柿在生长过程中可能使用农药，在食用前应仔细清洗，最好使用流动水浸泡并轻轻搓洗，以减少农药残留的风险。选择有机西红柿也是降低这一风险的有效方法。
大多数人都能安全享用西红柿，但个别人群可能因体质差异对西红柿中的一些成分敏感，如胃酸过多者食用后可能加重胃部不适。西红柿本身不太可能直接与药物产生严重相互作用，但如果正在服用抗凝药物，大量食用富含维生素K的西红柿可能会影响药物的疗效。