如果黄豆在干净卫生环境正常发芽且无异常，可以正常食用；如果在不恰当的环境被微生物污染，此时不可食用；若发芽过程中接触化污染物，同样不可食用。
黄豆芽本身就是由黄豆发芽而来，在适宜的环境下黄豆继续发芽是自然的生长过程，如果黄豆芽是在干净、卫生的环境中，比如在经过清洗消毒的容器里，在适宜的温度、湿度和通风条件下正常发芽，且没有受到外界污染，豆芽的外观依然保持洁白、鲜嫩，没有出现软烂、变色、异味等异常情况，那么这样的黄豆芽是可以食用的。因为在这种情况下，黄豆芽的生长是健康的，其营养成分也没有发生有害的变化。
当发芽的环境不理想，如在潮湿且不卫生的环境中，或者与一些变质的食物放在一起，就容易受到微生物的污染。如果发现黄豆芽的根部出现了黑色或者褐色的斑点，或者豆芽整体变得软烂，散发出难闻的气味，这就表明黄豆芽已经被有害微生物侵染，此时是不能食用的。因为食用这样的黄豆芽可能会导致食物中毒等健康问题，如呕吐、腹泻、腹痛等症状。
如果在发芽过程中接触了一些化学物质，比如被农药、化肥等污染，或者是在被重金属污染的土壤中生 长出来的，那么这样的黄豆芽也是绝对不能食用的。这些化学物质和重金属会在黄豆芽体内积累，对人体造成严重的危害，可能会损害人体的神经系统、肝脏、肾脏等重要器官。
当面对发芽的黄豆芽时，不要急于判断是否可食，要仔细检查其外观、气味以及生长环境。避免食用来源不明或有异常的黄豆芽，在种植或购买黄豆芽时，确保其生长环境清洁、无污染，以保障食用安全。