甲沟炎是临床上比较常见的疾病，一般来说，如果甲沟炎症状比较轻微，并不影响正常生活，这种情况可以短时间进行跑步，但不要过度劳累。如果甲沟炎感染比较严重，已经造成局部化脓性感染，这种情况患者走路都会伴有明显的疼痛症状，不能够进行跑步锻炼。
甲沟炎比较轻微的患者一般不会造成局部化脓性感染，这种情况可以局部外敷，如使用如意金黄膏或碘伏纱布，可以使局部的炎症得到控制，平时避免过度修剪及挤压趾甲。当炎症控制后并不会严重影响患者的正常生活，此时患者可以正常进行跑步等有氧锻炼。
如果患者的甲沟炎是由于指甲反复嵌入肉内造成的，这种情况会引起局部反复感染，甚至形成脓肿，单纯通过局部的保守治疗效果不好，需要通过手术治疗切开脓肿或拔除趾甲，才能促使局部感染较快恢复。此时会严重影响患者的正常活动，不能够跑步，但由于甲沟炎感染相对比较局限，即便进行手术治疗，大部分在2周左右可以逐渐恢复正常，只要局部感染恢复，患者可以正常跑步锻炼。