菠菜根是否可以吃，需要根据菠菜根的具体情况而定。若菠菜根发生腐烂的情况，会产生大量细菌，细菌在繁殖的过程中可能会产生大量毒素，人体进食后可能会刺激肠胃而导致胃肠道不适，如腹痛、腹泻等。而且需要注意，菠菜根发生腐烂时，可能还会蔓延至整个菠菜，为避免对机体产生不良影响，此时整个菠菜都不建议食用。
菠菜根中含有纤维素、维生素，同时脂肪含量较低，适量食用对人体有一定的益处，在食用时可以不用丢弃，与菠菜一同食用。菠菜根还含有丰富的胡萝卜素、钙、铁、维生素等营养物质，有利于预防人体微量元素的缺乏，铁元素对于贫血有较好的辅助治疗作用，胡萝卜素、维生素A对于上皮细胞有保护作用，可以保护眼睛视力。菠菜根还含有类似于胰岛素的物质，对于血糖的控制有一定的帮助，所以糖尿病患者可适当食用。
菠菜根中草酸含量较高，食用后可能会影响锌和钙的吸收，因此，建议在焯水后食用，有利于去除菠菜根中含有的草酸。