若只是蛋白粉和可乐偶尔一起喝，喝的量较少时一般不会产生副作用，若是经常一起喝或一次性喝太多，可能会影响营养的吸收，还可能会刺激胃肠道，不利于身体健康。
蛋白粉和可乐长期一起搭配喝，可能会导致蛋白粉中的营养成分受到破坏，不利于营养吸收，且可乐还会对胃肠道产生刺激，如果一次性喝太多可乐和蛋白粉，容易导致出现腹痛、腹胀、恶心、嗳气等症状，不利于身体健康。蛋白粉含蛋白质比较丰富，可以补充机体所需营养，适合身体虚弱或老年人喝，可乐属于碳酸饮料，经常喝些碳酸饮料可能会导致身体的钙质大量流失，对身体健康不利，因此要少喝可乐。
可乐中还含有较多糖分，经常喝可乐可能会导致身体肥胖，甚至还会导致糖代谢负担加重，引起糖代谢异常，存在糖耐量异常或患有糖尿病者，不要喝可乐。