HPV指人乳头瘤病毒，可引起人体疣病以及部分癌症，如尖锐湿疣、宫颈癌等。而艾滋病则指HIV，也可称为人类免疫缺陷病毒，因此HPV不是艾滋病，也不能引起艾滋病。
一般摩擦、外伤等导致人体形成微创伤后，当基底角质形成细胞后可能暴露于HPV，从而引起感染。HPV可作用于基底角质形成细胞，并随着角质形成细胞分化，完成复制周期，感染过程中可影响人细胞周期调节分子，导致细胞周期失控，引起疣病，如尖锐湿疣、跖疣、扁平疣等，如患者长期感染，并未进行有效控制，还可能引起恶性转化，导致宫颈癌、肛门癌，以及部分口咽癌。
艾滋病通过被感染者破损皮肤或黏膜暴露于感染源而感染，一般由于无保护措施性行为导致。艾滋病侵染CD4细胞后，可能造成CD4细胞计数渐进性下降，导致部分免疫功能缺失，出现适应性免疫系统紊乱与缺陷，引起艾滋病，艾滋病可导致多种机会性感染，甚至造成患者死亡。
HIV和HPV都可通过性途径传播，避免不洁性生活是预防感染的较佳方法，正确使用安全套也可避免HIV感染，并降低感染HPV的风险。