肾囊肿是以囊肿形成为主要特征的肾脏疾病，发病机制尚不完全明确，通常是多种内外因素作用引起的，且肾囊肿包括单纯性囊肿、多房性囊肿、多囊肾、肾盂旁囊肿等多种类型，具体病因存在一定的区别。
肾囊肿的发生与遗传、先天性肾内结构发育异常，以及后天外伤、感染、药物作用、年龄增长以及透析等造成肾内结构损伤有关。这些因素可引起肾小管及肾内淋巴管阻塞，肾单位局部扩张，进而形成憩室，同时体内表皮生长因子、胰岛素样生长因子等活性物质异常分泌等，从而引起肾囊肿。
如肾多房性囊肿，是因先天性肾小管发育不良、后天性肾脏炎症反应等原因引起；多囊肾为先天性遗传性疾病，婴儿型多为常染色体隐性遗传，患儿可因肾功能不全而早夭，成人型属常染色体显性遗传，发病时病情较严重。无论何种类型，患者均应及时就医诊治，避免病情持续进展。