目前还没有较为权威的江苏省神经内科医院排名，比较好的有南京医科大学第一附属医院、南京鼓楼医院、东南大学附属中大医院等。南京医科大学第一附属医院神经内科现由二个病区（70张床）、门诊、急诊、神经电生理实验室和临床神经病学研究室（脑脊液细胞研究室）所构成。每年收容各类神经系统疑难危重病人1000人次，门诊诊治7万多人次，急诊抢救近1万人次。本学科在神经系统各类疾病的诊治方面有着丰富的临床经验，尤其是在卒中病人的急诊救治有着许多显著地特色。 南京鼓楼医院神经内科内为国家临床重点专科、江苏省临床重点专科，江苏省神经病学重点学科，江苏省脑血管病诊疗中心、江苏省脑卒中救治联盟牵头单位。设脑血管病、神经重症、认知障碍、帕金森与运动障碍、睡眠障碍、癫痫与发作性疾病、神经遗传与肌肉疾病、神经免疫和感染性疾病、神经电生理、神经系统罕见病和头痛11个亚专科，拥有磁共振/CT室、脑电图室（包括视频脑电、动态脑电、定量脑电、睡眠脑电）、经颅多普勒室等。 东南大学附属中大医院神经内科是江苏省神经病学研究中心（共建单位），江苏省医学重点学科，江苏省临床重点专科，国家级药物临床试验机构，神经病学硕士/博士学位授予点和博士后流动工作站。临床拥有病床120张，包括神经系统危急重症、脑血管病、神经变性病（如帕金森病、痴呆、癫痫）、神经遗传免疫和肌肉病、神经心理疾病五个亚专科。