南京脑科医院神经内科是南京脑科医院的特色学科之一，始建于1947年，是国内建科最早、获批部级神经病学高级师资研修班基地最早的单位之一，国内第一例气脑造影术以及第一台脑电图机的使用均在我院神经内科首开先河，素有国内“神经科医师摇篮”之称。经过76年的发展，神经内科已成为全国最大、技术先进的神经病学医疗、教学和科研中心之一。神经内科现设5个病区，240张病床，年收治病人7000人以上，门诊就诊病人达30万人次，吸引着全省乃至全国的疑难重症病人，全科本着“仁爱奉献、大医精诚”的院训，以高水平的专业队伍与技术为广大患者提供温馨、特色化的诊疗服务。

目前，神经内科是南京医科大学神经病学博士和硕士学位授予点、博士后流动工作站；南京大学硕士学位授予点；国家神经内科临床药理基地；国家级神经内科住院医师规范化培训基地；国家高级认知障碍诊疗中心；CAAE综合癫痫中心（三级）；中国帕金森诊疗培训基地暨帕金森病一站式诊疗中心；全国首批罕见病诊治中心，全国脑炎专业诊疗中心；国家卫健委授牌的脑卒中筛查与防治基地医院、高级卒中中心；中国卒中学会授牌的综合卒中中心、卒中区域性培训和质控示范中心。江苏省医学会神经内科专业委员会主委单位；江苏省首批临床重点专科；江苏省卫健委神经病学进修培训基地；有教授或主任医师21人，副教授或副主任医师25人，博士研究生导师4人，硕士研究生导师11人。