莆田市儿童医院推荐选择该地区三甲综合医院儿科排名靠前的莆田市第一医院、莆田学院附属医院、解放军95医院等。 莆田市第一医院儿科已经成为了集保健、医疗、教学、科研、培训及技术指导于一体的非营利性三甲级等医院的综合学科，设有新生儿医学中心(含NICU)、儿童重症医学(PICU)、儿童保健、儿童生长发育、呼吸、消化科、神经内科、肾内、心血管、血液、内分泌等专科亚专业。在新生儿疾病、慢性咳嗽、哮喘、重症肺炎、消化道疾病、过敏免疫疾病以及危重患儿抢救技术居市内领先水平。 莆田学院附属医院儿科是集医疗、教学及科研于一体的综合性学科，擅长儿科常见病、多发病及疑难杂症的诊治，尤其是对呼吸系统（、支气管哮喘、慢性咳嗽等）、消化系统（小儿腹泻病、胃炎、消化性溃疡）疾病的诊治取得了显著的疗效，对于儿科少见病如川畸病、过敏性紫癜、风湿热及寄生虫疾病亦有丰富的临床经验。 解放军95医院儿科是由一批临床经验丰富的主治医师以上职称的医务人员组成。熟悉儿科常见病、多发病、疑难病的诊治，尤其在治疗小儿肺炎、支气管哮喘、小儿发热、小儿鼻炎、小儿扁桃体炎、维生素D缺乏性佝偻病、小儿营养不良、小儿哮喘等方面具有显著优势。